Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2AQ12879 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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