Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DHODHQ02127 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DHODHQ02127 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DHODHQ02127 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DHODHQ02127 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DHODHQ02127 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms