Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PRCDQ00LT1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PRCDQ00LT1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms