Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK2A1P68400 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK2A1P68400 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms