Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACTG1P63261 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms