Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms