Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDST1P52848 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDST1P52848 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDST1P52848 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms