Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RANGAP1P46060 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms