Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACVR1BP36896 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACVR1BP36896 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms