Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC1P33527 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC1P33527 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms