Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms