Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX2P28328 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX2P28328 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms