Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms