Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms