Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSR1P21757 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSR1P21757 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms