Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASTP20810 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASTP20810 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms