Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms