Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPCAMP16422 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPCAMP16422 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms