Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB1P16220 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms