Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NR2C1P13056 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR2C1P13056 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms