Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEFHP12036 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEFHP12036 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms