Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms