Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APODP05090 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APODP05090 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APODP05090 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APODP05090 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APODP05090 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APODP05090 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms