Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms