Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms