Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APAF1O14727 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APAF1O14727 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APAF1O14727 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APAF1O14727 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms