Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms