Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA3F8WFD2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms