Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms