Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms