Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K4Q9Y6R4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAP3K4Q9Y6R4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAP3K4Q9Y6R4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAP3K4Q9Y6R4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms