Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP18Q9UMW8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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