Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms