Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRPF3Q9ULD4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms