Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF346Q9UL40 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms