Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL1Q9UK58 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms