Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RABGEF1Q9UJ41 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RABGEF1Q9UJ41 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RABGEF1Q9UJ41 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RABGEF1Q9UJ41 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1Q9UJ41 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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