Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MED13Q9UHV7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms