Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCF2Q9UG63 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms