Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms