Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms