Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms