Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATAD3AQ9NVI7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms