Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRHQ9HD43 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRHQ9HD43 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms