Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF3Q9H094 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms