Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AMBRA1Q9C0C7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms