Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPF3BQ9BZI7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms