Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRRTQ9BXP5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms