Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms