Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC22A12Q96S37 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms